| La Master Emerald dans Sonic Adventure 2 (Battle) |
 L'émeraude-mère réapparait dans cette nouvelle aventure sur Dreamcast / Gamecube. Knuckles, toujurs fidèle à son rôle de guardien, doit maintenant la protéger contre une nouvelle arrivante : Rouge, la chauve-souris avide de joyaux en tout genres. Hélas pour lui, dès le début du jeu, le Dr. Robotnik parvient à s'en emparer, profitant d'un moment d'inattention de l'échidné rouge. Knuckles, d'après l'expérience qu'il a eu dans Sonic Adventure 1, décide alors de briser l'émeraude pour la reconstituer plus tard. Sauf que maintenant, Rouge est également sur la piste des morceaux de la Master Emerald. 
Knuckles parviendra malgré tout à récupérer les pièces trouvées par Rouge, en lui sauvant la vie. De là, il lui est possible de reformer l'émeraude, de la même manière qu'il l'avait fait auparavant.  Knuckles récupère des morceaux de la Master Emerald.. |
 ..et la reconstitue. |
La Master Emerald ne révelera sa véritable puissance que dans la toute fin du jeu. Au centre de la station spatiale ARK, Knuckles et Sonic découvrent un autel spécialement conçu pour l'émeraude, possédant exactement la même forme que celui dans Sonic Adventure 1. Selon Sonic, ce paramètre permet d'exploiter l'énergie de la pierre au maximum. Knuckles, d'après les conseils de Rouge, installe la Master Emerald au centre de cet autel pour commencer ses incantations, les mêmes que dans le premier volet de la série des Adventures : (d'après la traduction française de Sega, dans le jeu lui-même) Les serveurs sont les sept Chaos, Chaos est la puissance, La puissance est enrichie par le coeur, Le contrôleur est celui qui unifie le Chaos. Seul toi peut le faire ! Neutralise les émeraudes du Chaos !
 Aussitôt, un éclair blanc aveugle tous les personnages présents sur la scène. Par microphone, le Dr. Robotnik confirme que la station spatiale ARK n'arrive plus à puiser son énergie dans les émeraudes. Ainsi, l'incantation de Knuckles a bel et bien fonctionnée ; il démontre par là l'importance de son rôle en tant que gardien, et révèle l'une des utilités de la Master Emerald. A noter que, dans ce jeu, l'émeraude-mère n'intervient pas dans son rôle de protectrice de l'équilibre de l'Ile Flottante. En réalité, cette île n'est pas présente dans le jeu. La Master Emerald ne présente qu'un seul aspect, celui de son pouvoir sur les émeraudes du chaos.
| La Master Emerald dans Knuckles'Chaotix |
 Knuckles'Chaotix est un jeu unique en son genre dans la série Sonic. C'est le premier jeu qui, bien avant Sonic Heroes, avait mis en place un système de coopération entre deux membres d'une équipe. C'est également dans ce jeu que Espio, Vector et Charmy ont fait leur première apparition, d'où le nom de « Team Chaotix » dans Sonic Heroes. Sorti en 1995, ce jeu n'a pas connu un grand succès. La raison principale vient du fait qu'il est paru sur une autre « console maudite » crée par Sega : la 32X, une extension de la Mégadrive, et qui se branchait comme une cartouche. Le but était d'augmenter considérablement la puissance de la Mégadrive, en lui permettant même la gestion de la 3D, sans parler des effets de rotation, de distorsion et de zoom dans les jeux encore en deux dimensions. Cette console ne s'est jamais réellement vendue, la plupart des éditeurs de jeux refusant de développer pour cette plate-forme. Knuckles'Chaotix garde une caractéristique majeure : ce jeu n'inclus pas Sonic dans les personnages. En revanche, et comme le nom l'indique, c'est Knuckles qui sera chargé cette fois de débarrasser Carnival Island du Dr. Robotnik. Le jeu prend place peu après les événements de Sonic 3 & Knuckles, comme le rappelle le manuel japonais du jeu :
Une île qui flotte quelque part dans le monde. Quelques mois sont passés depuis cet incident qui fit tomber l'île à la surface de l'océan. Puis, une activité survenant dans les profondeurs des Southern Oceans, et une île qui apparaît. Ce sont les résultats de l'activité tectonique stimulés par le Temple de la Master Emerald sur l'île qui lévite. Qu'y a-t-il de plus, la forme de l'île a commencé à s'altérer à une vitesse incroyable. L'énergie du Temple commençait à changer l'île, d'un grand rocher en un paradis tropical.
 Robotnik fut rapidement averti de ces changements. Un anneau qu'il trouva le renseigna sur la nature des événements : gravés à l'intérieur, des lettres étranges prouvaient que cette « île qui lévite » était bien habitée par une civilisation disparue. Aussi, Robotnik se mis en chemin, afin de retrouver la Master Emerald. Knuckles, de son coté, se devait d'intervenir, étant le gardien de l'émeraude-mère. Mais arrivé trop tard, il n'eu la possibilité que de découvrir la nouvelle forteresse du Dr, que celui-ci avait appelé « Newtrogic High Zone ». Aussi, Knuckles n'avait pas le choix : il devait détruire la base de Robotnik, pour protéger une fois de plus son île, selon le devoir qui lui avait été assigné.
Cette aventure ne présente que peu d'aspects de la Master Emerald ; elle confirme simplement le rôle de cette pierre dans le bon fonctionnement de l'île protégée par Knuckles. L'émeraude, là encore, permet notamment à l'île de flotter dans les airs.
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