Après les cinématiques vous prenez le contrôle de Tails pour la première mission.
Mission 1 : Allez au cœur de la colonie
Dernier niveau, le plus dur, le plus long, le plus hardcore. Aucune sauvegarde entre les différentes étapes. Ce niveau se découpe en 5 étapes avec 5 persos différents. A tour de rôle vous contrôlez Tails, Eggman, Rouge, Knuckles et enfin Sonic. Au début vous débutez avec Tails, vous devez atteindre la porte de contrôle et la détruire. Pas trop difficile mais faites gaffe à la fin, face à la porte, car des robots vous tombent dessus.
  
Ensuite vous prenez le contrôle d'Eggman et vous devez faire la même chose mais le niveau est plus ardu cette fois-ci. PS : Si vous jouez avec le jeu jap sur une DC européenne, ce passage plante. Pour vaincre ce bug, cf. le forum et l'astuce.
   
Troisième étape plus complexe avec Rouge. Vous commencez dans une salle centrale. Grimpez aux pylônes et arrêtez le temps. Ensuite allez dans un passage qui s'est dégagé. Ensuite débrouillez-vous pour passer dans le tunnel, attendez le dernier instant puis stoppez le temps. Dans la salle suivante activez l'interrupteur, revenez dans la salle centrale du début et drainez le liquide en sautant sur le bouton du milieu.
 
 
Knuckles se charge de la quatrième étape. Dans cette phase vous avez absolument besoin de l'Air Necklace. Plongez sous l'eau et arrêtez le temps ; remontez vite et passez. Ensuite détruisez les caisses au sol et activez un nouvel interrupteur qui désactivera les lasers de la salle centrale. Plongez de nouveau et prenez un passage ouvert. Même principe que dans l'étape de Rouge. Entrez dans la pièce, détruisez la capsule qui détruit tous les ennemis puis activez l'interrupteur et prenez le tunnel. Là il faut être rapide et arrêter le temps à chaque fois. Ensuite vous descendez dans une salle inondée de liquide bactériologique et remplie de lasers. Comme d'habitude stoppez le temps et passez. Ouvrez la porte et vous accédez à la dernière phase du niveau.
  
Dernière phase beaucoup plus speed avec Sonic. Le chemin est tout tracé et très linéaire, pas beaucoup de pièges. Juste une fois faut arrêter le temps pour passer sous des barrières. A un moment vous prenez le tunnel et vous arriverez à 2 toboggans. Débrouillez-vous pour trouver le bon toboggan qui vous assure la vie parce que l'autre vous mène droit à la mort ;). Le bon toboggan choisi, lancez-vous et laissez-vous guider jusqu'à la fin. Le niveau est enfin terminé. \o/
  
Mission 2 : Ramassez 100 anneaux
Cette mission est longue, très longue. Vous ne pourrez pas la finir juste avec Tails et Eggman. Il va falloir se débrouiller pour en collecter un max avec Rouge et finir avec Knuckles. Faites gaffe, si vous vous faites toucher rien qu'une fois vous êtes parti pour tout recommencer sinon vous n'aurez jamais 100 anneaux.
Mission 3 : Trouvez le Chao perdu
Ce Chao est complexe à trouver et se déroule sur 4 étapes. On commence par Eggman, lorsque vous arrivez à un passage rempli de lasers, vous y trouverez une porte difficile d'accès. Essayez de l'atteindre et vous y trouverez le premier temple. Ensuite avec Rouge, un nouveau passage apparaîtra grâce à l'activation du premier temple avec Eggman ; le second temple s'y trouve. On continue avec Knuckles et faut grimper sur les plates-formes apparues pour accéder au dernier temple. Voilà à partir de maintenant vous trouverez le Chao avec Sonic. Avec Sonic, dirigez-vous directement au double toboggan. Au milieu de ces toboggans, vous remarquerez une rangée d'anneaux. Effectuez un Light Dash puis continuez jusqu'à ce que vous trouviez le Chao. Au passage quelques ennemis seront présents donc faites gaffe.
Mission 4 : Atteignez le but en 7 minutes
Pas d'astuces, ALLEZ LE PLUS VITE POSSIBLE, tracez votre route sans se soucier des items trop compliqués à obtenir, arrêtez le temps dès que vous le pouvez.
Mission 5 : Terminez le mode difficile
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